『我們就是來無影、去無蹤的科學小飛俠!』

在第一代科學小飛俠卡通中,五個科學小飛俠分別是白鳥一號、黑鷹二號、天鵝三號、飛燕四號和貓頭鷹五號﹔因為五號阿龍必須要留守鳳凰號,所以除了阿龍外,每個人都有自己的座機與自己的隨身武器。五個成員的手腕上都戴有一只電子錶,能夠用來通訊以及使出火鳥功來變身,當五個人團結在一起時,可以使出龍捲風。

鳳凰號上有兩種主要武器,一是神鳥飛彈,另一是火鳥功﹔當進行火鳥功時,鳳凰號會變成一隻火鳥翱翔天際,並且發出三千度的高溫(可用以鎔毀敵人的機械獸),不過這兩種武器必須要五人到齊才能使用﹔後來,南宮博士改善了必須五人到齊才能使用武器的缺點。科學小飛俠平時駐紮在海中珊瑚礁基地。

也不曉得惡魔黨的首領是打哪兒來的,他老是想要毀滅地球,他的手下皮爾是惡魔黨的大頭目﹔皮爾是一個智慧非常優越的陰陽人,常稱科學小飛俠為傻鳥。

第一代科學小飛俠故事的結局是:惡魔黨在喜馬拉雅山建造基地,並在那裡挖掘地心通道,還使用核子彈來爆破地心﹔後來,科學小飛俠雖然摧毀了那個基地,但卻停不了那個爆破地心的機器,就在科學小飛俠束手無策、倒數0002秒之際,機器卻停了,那是因為大明臨死之前射出的羽毛飛鏢被捲入了機器之中,而使機器停止運轉。最後,科學小飛俠們順利挽救了地球,但是大明卻死於惡魔黨的基地裡。

旋風小飛俠是第二代和第三代科學小飛俠的結合,大明雖於科學小飛俠時代喪生了,但卻被羅素博士以科技再造人身而復活。在旋風小飛俠中,惡魔黨的首領為了繼續摧毀地球,他以「誕登挫骨」的手法讓一個七歲小孩變為成人,擔任惡魔黨的大頭目,其名字就叫做杜蘭莎,而首領自己則化名為無名主宰﹔事實上,這無名主宰是一個機器活腦,它會到處流竄,唯有大明的心臟上有特殊裝置,可以追蹤無名主宰。但是,無名主宰很聰明,每次它將要被摧毀之際,它會先用分身組合成一個宇宙宮殿,寄生於其中以避免被摧毀。

在第二代科學小飛俠中,五個人的武器和座機通通都更新了,連阿龍也有自己的座機﹔新鳳凰號的造型更接近一隻鳳凰,以前的神鳥飛彈則改成了火鳥飛彈,作戰方式和第一代科學小飛俠差不多。

在第三代科學小飛俠中,壞人的角色則是由宇宙宮殿和地球上的辛格萊家族一同扮演﹔辛格萊想統治地球,而無名主宰卻想毀滅地球,兩邊各懷鬼胎。這時候科學小飛俠的作戰就比較有組織和計劃,也曾去竊取作戰計劃﹔科學小飛俠戰起來較以前辛苦,尤其是鐵雄,為要使出雷電閃光,他須加強三項電壓,而使得自己的身體不堪負荷。辛格萊家族自己也鬧分裂,辛彪是辛格萊手下的大將,他反叛想稱王,但被辛格萊給幹掉。辛格萊最後也和無名主宰反目,導致無名主宰發動小惑星要來撞擊地球,這就是所謂的毒蘋果和七個小矮人﹔毒蘋果便是小惑星,七個小矮人就是牽引小惑星的七顆衛星。

此時,南宮博士已死,他留下了一枚徽章給小飛俠,小飛俠們費盡心力摧毀了三個牽引衛星,本想小惑星的軌道已亂,不會撞上地球,豈知宇宙宮殿突然出現並且發出AQ3射線,繼續牽引小惑星撞向地球,小飛俠們只好侵入宇宙宮殿中進行破壞,最後雖然破壞了宇宙宮殿,但科學小飛俠也都身受重傷,個個動彈不得,這時南宮博士的那枚徽章突然發出光華,帶著科學小飛俠們變成火鳥,翱翔天際

科學小飛俠(科學忍者隊)於日本上映時間一覽表

科學小飛俠 科學忍者隊(科學小飛俠)
Gatchaman
形式:30分鐘一集
集數:105集
製作:1972年(昭和47年)
放映:1972.10.1∼1974.9.29
劇情:略

科學小飛俠2 科學忍者隊II (旋風小飛俠)
Gatchaman 2
形式:30分鐘一集
集數:52集
製作:1978年(昭和53年)
放映:1978.10.1∼1979.9.30
劇情:略

科學小鬥士 科學忍者隊F (旋風小飛俠)
Gatchaman F
形式:30分鐘一集
集數:48集
製作:1979年(昭和54年)
放映:1979.10.7∼1980.8.31
劇情:略

科學忍者隊 (劇場版) 科學忍者隊 (劇場版)
Gatchaman
長度:110分鐘
上映:1978.7.15
發行:松竹•富士映畫共同配給
劇情:略

科學忍者隊 (OVA) 科學忍者隊 (OVA)
The Gatchaman OVA
第一集:1994.10.1
第二集:1995.1.1
第三集:1995.4.1
長度:每集為50分鐘